А. С. Истомина Масличный лен – сельскохозяйственная культура, масло которой является ценным источником полиненасыщенных жирных кислот. В настоящее время остро стоит вопрос о молекулярно-генетической паспортизации сельскохозяйственных растений в РФ, в том числе льна. Существующие методики обладают рядом недостатков, что обусловливает необходимость поиска новых высокоинформативных ДНК-маркеров. Целями исследований являлись in silico и экспериментальная проверка микросателлитных (SSR) маркеров из источников литературы, оценка их полиморфизма и информативности для поиска кандидатов для включения в панель ДНК-маркеров для мультиплексной ПЦР и разработки генетических паспортов сортов льна, а также определение внутрисортового полиморфизма сортов льна для оценки возможности их надежной паспортизации и дальнейшей идентификации. Для отбора оптимальных микросателлитных (SSR) маркеров был проведен биоинформатический анализ более 1300 нуклеотидных микросателлитных последовательностей из источников литературы. Критериями отбора служили: 3–6 нуклеотидный мотив, специфичность амплификации in silico и температура отжига праймеров. В результате предварительного скрининга отобрано 63 из них. Их экспериментальная проверка на 7 сортах масличного льна селекции ВНИИМК позволила идентифицировать 27 перспективных локусов. Дальнейшая валидация на расширенной панели из 23 сортов показала, что большинство маркеров обладают умеренным или низким дискриминационным потенциалом (PIC от 0,08 до 0,46). Исключение составили 4 высокополиморфных SSR-локуса: KY326304, KY326942, KY326968 и Lu2332 (PIC > 0,5), которые рекомендуются для включения в итоговую панель маркеров для создания генетических паспортов. Анализ внутрисортового полиморфизма, исследованный на малых выборках с помощью 27 маркеров, выявил его низкий уровень (средние значения: Na = 1,27; N e = 1,19; I = 0,15). Это подтверждает возможность молекулярно-генетической идентификации сортов льна. Для создания полноценной методики паспортизации необходимо продолжение исследований, направленных на разработку новых информативных SSRмаркеров с применением современных биоинформатических подходов и анализа данных геномных библиотек.
Научная статья 
паспортизация