Актуальной задачей для молочного скотоводства является изучение генетической структуры популяции по полиморфным системам, что служит одним из элементов генетического мониторинга. На основе анализа новых методов оценки генотипов животных целесообразно не только увеличение молочной продуктивности, но и отдельных качественных показателей молока коров. Целью исследований явилось изучение частоты встречаемости аллелей гена Bola-DRB3 у быков-производителей голштинской породы. На основании проведенного анализа отмечено, что из 10 аллелей гена Bola-DRB3, у которых установлена связь с показателями молочной продуктивности, наиболее высокая частота встречаемости отмечена у аллеля 22 (25,2%), а наименьшая - у аллелей 10 и 26 (2%). Анализ продуктивности дочерей быков-производителей, имеющих в генотипе чувствительные (Ч), нейтральные (Н) и устойчивые (V) аллели, показал, что более высокие показатели оценки имели быки-носители чувствительных аллелей гена Bola-DRB3.