Федеральные государственные информационные системы (ФГИС) в сельском хозяйстве России являются одним из результатов и направлений цифровой трансформации отрасли. С учетом практики применения и потребностей ФГИС могут быть усовершенствованы на основе выявленных недостатков, возникающих при их использовании сельскохозяйственными производителями. Основной метод исследований – онлайн-опрос 957 действующих сельскохозяйственных организаций по всем субъектам РФ, проведенный в течение I полугодия 2024 г. Предмет исследований в рамках опроса – опыт использования ФГИС в сельскохозяйственных организациях и проблемы, с которыми они сталкиваются при этом. Проведенные исследования подтверждают наличие соответствующих проблем, которые заключаются в основном в жалобах на удобство и функционал, а также на стабильность работы ФГИС. Наиболее частые вопросы вызывают ЕФИС ЗСН, ФГИС «ВетИС» и ФГИС «Сатурн». Наиболее эффективными являются НСЦМ «Честный знак» и ФГИС «Аргус-Фито». Для решения выявленных проблем предлагается несколько рекомендаций. Во-первых, важно создавать стимулы по инвестированию в основной капитал, что в конечном счете будет выражаться и в ускорении цифровой трансформации отрасли. Во-вторых, необходимо применять системный подход, подразумевающий объединение функций ФГИС в «едином окне» внутри цифровой экосистемы и включающий в процесс разработки, внедрения и использования ФГИС в качестве аудиторов различные заинтересованные стороны, в том числе академическое сообщество. Это позволит повысить стабильность функционирования ФГИС. В-третьих, необходима актуализация данных сельскохозяйственных производителей, поскольку складывающиеся условия не позволяют собирать многие данные автоматически, что приводит к восприятию ФГИС как излишне сложных систем. В-четвертых, необходима более тщательная работа по моделированию сценариев использования ФГИС сельскохозяйственными производителями и представителями госорганов с учетом реально располагаемых трудовых ресурсов, что позволит улучшить удобство и функционал. Опрос сельскохозяйственных производителей показал, что удобство и функционал могут быть улучшены внедрением мобильных версий (приложений) с возможностью работы как онлайн, так и оффлайн. В-пятых, образованная цифровая экосистема должна предоставлять достаточный уровень свобод, необходимых в условиях ограничений существующих экономических санкций.