Основными методами оздоровления растений яблони от латентных вирусов являются термотерапия и хемотерапия. В зависимости от вида вируса применяемые методы оздоровления растений яблони могут быть различными и требуют совершенствования применительно к биологическим особенностям подвоя 62-396 и свойствам вирусов. Цель исследований – изучение особенностей оздоровления от основных вредоносных вирусов клонового подвоя яблони 62-396 с применением методов комплексной терапии in vitro. Оздоровление растений клонового подвоя яблони 62-396 от вирусов ACLSV, ApMV и ASGV проводили в 2021-2022 гг. с использованием антивирусных препаратов (АВП) рибавирина (эталон) 40 мг/л, фенолкарбоновой кислоты 30 мг/л и циклопентанона 2,5 мг/л при температурах воздуха +20ºC и +38ºC. Термотерапию эксплантов при температуре +38ºC проводили в условиях климатостата КС-200 СПУ на протяжении трех месяцев. Магнитно-импульсную обработку (МИО) проводили аппаратом АМИС-8. При температуре +20ºC установлена возможность использования АВП на протяжении 45 и 90 дней. При сочетании АВП с температурой +38ºC на протяжении 45 дней отмечали относительно высокие параметры выживаемости эксплантов, тогда как увеличение длительности до 90 дней приводило к снижению выживаемости в 1,7 раза. Высокую выживаемость обеспечивало сочетание температуры +38ºC и МИО (без АВП), температуры +38ºC и фенолкарбоновой кислоты – 81,3 %, среднюю выживаемость – температуры +38ºC + рибавирина, температуры +38ºC + рибавирина + МИО, температуры +38ºC + фенолкарбоновой кислоты + циклопентанона – 56,3 %. Параметры роста у эксплантов подвоя яблони 62-396 зависели от вида АВП, температуры и МИО. Применение изученных АВП при температуре +20ºC через 1,5 месяца культивирования приводило к снижению числа побегов в 2,1-3,2 раза по сравнению с контролем. Повышение температуры до +38ºC во всех вариантах ингибировало образование побегов, приводя к снижению их числа в 2,9 раза в контроле, в 1,1-1,5 раза – в вариантах с АВП. Обработка импульсами магнитной индукции уменьшала ингибирующий эффект высокой температуры в контроле. Выход свободных от латентных вирусов эксплантов клонового подвоя яблони 62-396 in vitro с применением различных методов оздоровления составлял 50 %. Низкий индекс зараженности вирусами (1,2 – для ACLSV и ASGV, 1,6 – для ApMV) отмечен при комплексной терапии с применением АВП (фенолкарбоновая кислота + циклопентанон), термо-и магнитотерапии.