А. В. Лунева В статье описаны данные по изучению таксономического разнообразия микроорганизмов, обитающих в желудочно-кишечном тракте, а именно в слепых отростках кишечника одомашненных фазанов двух видов (кавказские, румынские). Кроме того, проведены выделение и идентификация доминирующих представителей рода Lactobacillus как перспективных представителей штаммов-пробионтов. Состав таксономических групп микроорганизмов в содержимом слепых отростков кишечника фазанов изучался современным бактериальным метагеномным исследованием. Выделение чистых культур превалирующих видов рода Lactobacillus из химуса слепых отростков кишечника фазанов осуществлялось классическими микробиологическими методами. Идентификация доминирующих лактобактерий проводилась масс-спектрометрически на MALDI-TOF MS. Полногеномное секвенирование доминирующих представителей рода Lactobacillus осуществляли согласно протоколам исследований на приборе MiSeq (Illumina). В результате бактериального метагеномного анализа выявлено, что в содержимом слепого отростка кишечника фазанов обоих видов на уровне «филы» преобладали представители Proteobacteria и Firmicutes, на уровне «класса» ‒ Gammaproteobacteria , Bacilli и Clostridia , на уровне «отряда» ‒ Pseudomonadales, а на уровне «рода» ‒ Psychrobacter. При выделении и идентификации представителей рода Lactobacillus масс-спектрометрическими исследованиями на приборе MALDI-TOF MS установлено, что доминирующее превосходство заняли такие, как Loigolactobacillus coryniformis, Lactobacillus johnsonii и Lactobacillus reuteri. В результате полногеномного секвенирования ДНК чистых культур лактобактерий была подтверждена их видовая принадлежность, а также в геномах Loigolactobacillus coryniformis и Lactobacillus johnsonii были выявлены структуры, ответственные за выработку ряда бактериоцинов.
Научная статья 
бактериоцины